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有很多的疾病和失調會影響到鳥的皮膚和羽毛。有一些是因為遺傳，當然也有其它原因，例如寄生蟲，這可以省略掉。認識一些令人擔心的問題，以及當問題發生時如何去解決，讓鳥兒能夠舒服，甚至救了它的性命。以下是針對這些皮膚問題作討論：
羽毛囊腫
羽毛囊腫發生是一個或多個羽毛濾泡變成橢圓形或延長的腫脹。雖然可能發生在任何地方，但最主要發生的地方是在翅膀。這是因為正在成長的羽毛無法突破皮膚表層，而將羽毛濾泡捲曲。隨著羽毛不斷地成長，腫脹的地方會繼續擴大，並且有類似乾酪的角質累積。雖然這種問題會發生在各種種類的鸚鵡身上，但發生機率最高的是在藍黃金剛鸚鵡，還有幾個品種的金絲雀。可能是因為遺傳的關係，例如：某幾種金絲雀；或者是因為傳染、外傷而引起的。治療的方法是利用外科手術將腫塊連羽毛濾泡一起切除，如過只是移除羽毛和累積的角質，還是會再復發的。
禿頭
意思是說頭上幾乎沒有羽毛，常發生於金絲雀。一般認為是荷爾蒙不安定和遺傳的原因造成。
啄羽症
很多人相信這種啄羽毛的損害是因為癢和傷口的關係造成。但是非常重要的是經過皮膚的切片檢查之後，發現和傷口並沒有直接關係。要找出啄羽症的原因，必須等到其它原因排除之後，才可能有明確的診斷。
臘膜肥大
這種現像最常見於阿蘇兒身上。因為臘膜肥大，變成角質，可能會發展出類似有角的凸出物。這種現像在母鳥的機率最高，一般相信和飼養母鳥的雌激素分泌物有關。
毛囊炎
這是因為多支羽毛在同一個羽毛濾泡成長，可能會沒有任何影響，或者皮膚、濾泡會長期發炎。常見於愛情鳥和阿蘇兒身上，通常以尾巴和脖子的背部這些區域最容易發生，這種現像可能是因為濾過性病毒引起。
蝨子
大部份鳥兒的寄生蟲疾病都是蝨子所引起，其中有幾種種類的蝨子會同時對羽毛和皮膚侵襲。大部份蝨子都是寄生在皮膚表層部位，然後襲擊寄居的地方；假如臘膜也被侵襲的話，那鳥嘴會變形。
這些住在皮膚表層的蝨子，可以藉由皮膚磨擦把蝨子刮掉；但是其它種類的蝨子，會深深勾住皮下組織，就必須做切片檢查的診斷。最普通的兩種蝨子為（Knemidokoptes）和（Myialges）。
【Knemidokoptes】會導致疥癬這種形態的疾病，例如：臉部鱗片、腳部鱗片。這些蝨子存在於臘膜、鳥嘴、眼睛和腳等沒有羽毛的部位。不同種類的蝨子會影響不同種類的鸚鵡。這種蝨子最常出現在阿蘇兒身上，不過也有報告指出曾在別種鸚鵡出現過。這種發病非常緩慢，通常染病的鳥兒要經過一段很長的時間，才會顯現出病態來。開始時，鳥嘴的接縫處或臘膜會有一點點不癢的疣狀物，然後大規模地向沒有羽毛的身體部位侵襲。最後皮膚和鳥嘴會變成粗糙蜂窩狀，上面佈滿極小的坑坑洞洞，鳥嘴會變成彎曲，因為被蝨子影響了成長。許多鳥將須要長時間的修整和成長。金絲雀和雀科類較常發生在腳的部位，腳會變得有鱗片和硬殼，而且腳爪生長過快，並且很容易斷裂。感染到的鳥兒很難站在棲木上休息。
這種是細菌感染，並且會發生關節炎，必須用顯微鏡才能觀察。診斷方法是依據它們產生的特徵，然後自皮膚擦拭掉。Ivermectin、殺蟲劑對付這些蝨子似乎有點效用，而市面所售的蝨子噴灑液，似乎沒有多大效用。若不治療或有時治療，鳥兒會留下永遠的缺陷。
在鴿子方面，會導致很嚴重的搔癢，被稱為「羽毛疥瘡」。主要這些蝨子會深入羽毛濾泡，而引起搔癢，導致鳥兒去啄，而拔掉鳥毛。
【Myialges】第二種能感染鳥兒的蝨子，最常發現在灰頭鸚鵡身上，其他種類鸚鵡也會發生。同樣地感染這種蝨子的鳥兒，也會有嚴重的搔癢，變得疲憊不堪、掉羽毛、體重減輕，然後皮膚也變紅、很多鱗片和粗糙。如果不去治療，幾個月之內就會死亡。這種蝨子也是要用顯微鏡才能觀察到，發現它深入鳥兒的皮膚。在鳥兒飛行或清除的時候，可能會感染到其牠鳥兒。診斷是依照臨床經驗和徵兆，用Ivermectin將蝨子從皮膚擦拭去。
黃疣
從黃色變成濃厚的澄黃色，是由脂質和膽固醇累積的疣。常發生的部位在胸部、腿部和翅膀的尾端，這種疾病是有危險的。較常出現在阿蘇兒、玄鳳和鳳頭等鳥類身上。目前並不太清楚導致這種疾病的原因，不過應該是高脂肪的飼料所引起的。
潰瘡性皮膚炎
也就是說皮膚出現紅色、分泌物和潰爛。感染的部位通常會腫脹，並且鳥兒的白血球數會提高，暗示已經感染。會引起的原因為傷口、瘡疤、糖尿病和腸的寄生蟲。鳥兒啄這個部位，造成潰傷，這些潰傷的地方會又痛又癢，使得鳥兒一再啄這個傷口，然後又遭到細菌感染，造成二次損害。治療的方法是先將傷口清洗消毒，然後灑上適當的抗生素，再用頸圈套住鳥兒的脖子，讓鳥兒沒辦法啄到傷口，以利商口痊癒。愛情鳥、玄鳳、灰頭、亞馬遜和鳳頭等類的鸚鵡都會發生。
羽毛脂肪質
發生於尾巴後面，灰鸚、玄鳳、阿蘇兒、金絲雀和水鳥都會發生，亞馬遜鸚鵡就沒有這類問題。這是鳥兒整理羽毛將分泌物塗在上面，重要的是在防水。緊縮、長膿瘡、腫塊可能會發生。
腳的皮膚炎
是指鳥腳發炎或退化的狀況。較輕微的症狀是腳掌變紅和腫脹，嚴重的話會長膿瘡和危及到骨頭。
這通常發生於身體較重的鳥類，例如：亞馬遜、猛禽和水鳥。導致發生的原因，可能有營養不夠、不正確的棲木、不正確的環境和腳受傷。早期治療的話，大多能夠痊癒；但是如果到了很嚴重的狀況，包括傷及骨頭，那就不一定能痊癒了。
緊迫腳趾併發症
這種情況最常發生在年輕的鸚鵡，尤其是非洲灰鸚、金剛鸚鵡和折衷鸚鵡。任何腳趾都會被影響。因為三百六十度緊縮而造成腫脹，失去血液的供應，最後導致肌肉壞死而失去腳趾。這種情況的損害似乎是腳趾會線或者綿線纏繞而造成。會發生這種症狀的原因並不太清楚，不過大概是母鳥的孵化育雛時溼度太低的關係。假如能夠早一點發現，就可以利用外科技術將纖維帶子移除，然後復原。
四肢的乾躁壞疽
這種症狀常發生在小型鳥類身上，例如金絲雀、琉璃愛情鳥。這是因為不適當的築巢材料纏繞在鳥兒的腳和腳趾，因而切斷腳趾的運作。因為繩子的關係，造成腫脹和危及腳趾末端。假如能夠早一點發現，就可以利用外科技術將纖維帶子移除，然後復原。有太多不易看見的線或繩子，會造成大多數鳥而發生因纏住而腫脹。假如血液不能順利循環太久，就會發生腳趾脫落的現象。
脂肪瘤
開始於脂肪的腫塊。在亞馬遜鸚鵡、鳳頭和阿蘇兒的發生頻率較平常。高能量食物、肥胖和遺傳傾向都會導致脂肪瘤。發生的部位通常在胸骨和腹部，但是還是會發生在其它地方。大的脂肪或許會妨礙棲息和飛行，久而久之便會造成心理受創。而且鳥兒有時會咬這些脂肪瘤，造成流血和感染。均衡的飲食和適當的運動可以改善小塊的脂肪瘤，但大塊的脂肪瘤就須要外科手術了。
鳥嘴和羽毛疾病
是濾過性病毒所導致的，雖然第一次發現是在鳳頭鸚鵡，但是也會發生在很多鸚鵡身上，像鳳頭、玄鳳和愛情鳥。病狀是對稱的羽毛營養失調和掉落，鳥嘴畸形，甚至死亡。受感染的鳥兒散佈細菌在口部或呼吸道分泌物、排泄物或羽毛粉末。一般相信和年紀有關，因為年輕的鳥兒受到感染後，通常會導致死亡，但老鳥卻和平常一樣。這類病狀是急性的、嚴重的、慢性地發生。急性的是幼鳥會發生敗血症、肺炎和體重快速減輕，甚至死亡。這個併發症狀通常發生在非洲灰鸚和鳳頭鸚鵡。慢性地是鳥兒的羽毛在每次蛻換之後會顯得更畸形，留下羽毛梢，造成毛囊化濃而流血，而且短短棍狀的羽毛會呈現出來。粉狀掉落，鳥嘴不正常成長，生壞疽或鳥嘴破裂都可能發生。所有的鳥兒都應該做這類病菌的血液檢查，是否有這類病毒存在。
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